25 июля 2006 года состоялось первое заседание нового состава Совета директоров ОАО «Авиакомпания “Самара”». На нем большинством голосов на пост председателя Совета директоров авиакомпании был избран Андрей Бакшеев – заместитель генерального директора ООО «AiRUnion», директор корпоративного департамента.
Основными задачами акционерного общества на предстоящий период, по словам Андрея Бакшеева, является сохранение и укрепление позиций авиакомпании на рынке пассажирских и грузовых авиаперевозок, повышение экономической эффективности работы предприятия, а также дальнейшая интеграция в рамках первого авиационного альянса России: «В AiRUnion я занимаюсь блоком вопросов, связанных с объединением авиакомпаний-партнеров по альянсу, и мое избрание на пост председателя Совета директоров авиакомпании можно рассматривать как одно из проявлений процесса укрупнения авиакомпаний, характерного для отрасли в целом», – заявил новый председатель.