Министерства и ведомства области, получившие в 2009 году средства из федерального бюджета в рамках финансирования нацпроектов, расходовали их не по назначению. Факты о многочисленных преступлениях, связанных с нецелевым использованием бюджетных денег в 2009 году, содержатся в докладе об итогах работы за 2009 год управления по налоговым преступлениям ГУВД по Самарской области. Нарушения зафиксированы в рамках оперативно-профилактического мероприятия «Бюджетник».
Наибольшее количество преступлений совершено в таких нацпроектах, как «Доступное и комфортное жилье – гражданам России» – девять, из которых шесть направлено в суд, сумма возмещенного ущерба составила 2 млн 555 тыс. рублей. В рамках реализации нацпроекта «Образование» совершено 15 преступлений, девять уголовных дел направлено в суд. В «Развитии АПК» выявлено 39 преступлений, в суд направлено 17 уголовных дел, сумма ущерба 140 млн 858 тыс. рублей.
Всего по итогам операции «Бюджетник» в 2009 году проведено 384 проверки физических и юридических лиц, выявлено 65 преступлений, 33 уголовных дела направлено в суд.