В Самаре насчитывается 5962 зарегистрированных некоммерческих организации. Это один из самых высоких показателей по ПФО. В 2009 году в регистрационные органы губернии поступило 1221 заявление о государственной регистрации НКО. По сравнению с 2008 годом данный показатель вырос на 67%. Такой рост эксперты связывают с возросшей общественно-политической активностью некоммерческих организаций.
В 2009 году контрольными органами проведено 194 проверки деятельности некоммерческих организаций в губернии. По их итогам в суд были направлены 17 исковых заявлений о ликвидации некоммерческих организаций.